אנדומטריוזיס היא תסמונת שבה רקמת רירית הרחם מצויה גם על איברים מחוץ לרחם, לרוב באזור האגן וחלל הבטן, למשל סביב השחלות, החצוצרות, שלפוחית השתן, האזור בין הנרתיק לפי הטבעת והמעי הגס. לעיתים רחוקות יותר ישנם מוקדי רירית גם במקומות מרוחקים בגוף, כגון בסרעפת, בריאות, ואף במוח. מוקדים אלו, ממש כמו רקמת הרירית שמצפה את הרחם, מגיבים לגירוי הורמונלי, משגשגים בתחילת החודש, ואז נושרים ומדממים בזמן הווסת. מכיוון שלדם אין לאן לצאת, עשויות להיווצר הידבקויות בין מוקד של רקמה מדממת לבין איברים סמוכים וגם הצטלקויות. בשחלות לרוב נוצרות ציסטות שמכילות דם (אנדומטריומות) המכונות "ציסטות שוקולד".